Ernst Kovacic jako solista i dyrygent Ernst Kovacic współpracuje z wieloma orkiestrami kameralnymi – od 1996 do 1998 roku był dyrektorem artystycznym Vienna Chamber Orchestra. Spośród wielu orkiestr grał między innymi z Scottish, Irish and English Chamber Orchestras, Northern Sinfonia, Britten Sinfonia, Stuttgart Chamber Orchestra, St. Paul‘s Chamber Orchestra, Norwegian Chamber Orchestra, Klangforum Wien, ensemble modern, Camerata Salzburg oraz Bern i Deutsche Kammerphilharmonie Bremen.

W 2007 roku rozpoczął współpracę z Wrocławską Orkiestrą Kameralną Leopoldinum jako jej artystyczny dyrektor. Z tą orkiestrą wystąpił na festiwalach Flandern Festival, Brücken-Festival, Warszawska Jesień, Wielkanocnym Festiwalu Ludwiga van Beethovena w Warszawie oraz w czasie LEO Festiwalu we Wrocławiu. Dla firmy płytowej Phoenix nagrał wraz z Leopoldinum komplet kompozycji Ernsta Křeneka na orkiestrę smyczkową. W 2009 roku w katalogu firmy CD Accord ukazało się pierwsze nagranie Konzertstück C-dur młodego Beethovena.

Ernst Kovacic gra na instrumencie Giovanni Battista Guadagnini z 1753 roku.